교수진

FACULTY

교수

PROFESSOR
김정윤 교수
  • 이학박사
  • 김정윤
  • Jeong-Yoon Kim, Ph.D.
  • 세포노화학 및 분자세포생물학 (세포극성 및 세포노화)
  • 생명시스템과학대학 605호
  • 세포및분자생물공학실험실(N11-605호)
  • 042-821-6419, 7554
  • jykim@cnu.ac.kr

학력

  • 학사(1984) : 서울대학교 미생물학과 (이학사)
  • 석사(1986) : 서울대학교 미생물학과 (이학석사)
  • 박사(1992) : University of California, Davis (이학박사)

경력

  • 1987-1988 : 유전공학연구소 연구원
  • 1992-1993 : UC Davis, 화학공학과 박사후 연구원
  • 1993-1995 : 충남대학교 미생물학과 전임강사
  • 1995-1999 : 충남대학교 미생물학과 조교수
  • 1999-2004 : 충남대학교 미생물학과 부교수
  • 2004-현재 : 충남대학교 생명과학부 교수
  • 2008-2009 : Univ. of Virginia, 의과대학 세포신호전달센터 방문교수

연구업적

  • Hong E-H, Kim J, Kim J-H, Lim D-S, Kim M, Kim J-Y. BIG2-ARF1-RhoA-mDia1 signaling regulates dendritic Golgi polarization in hippocampal neurons. Mol Neurobiol. (2018) Accepted.
  • Kang WK, Devare M, Kim J-Y. HST1 increases replicative lifespan of a sir2 mutant in the absence of PDE2 in Saccharomyces cerevisiae. J Microbiol. (2017) 55(2):123-129
  • Kang WK, Kim YH, Kang HA, Kwon K-S, Kim J.-Y. Sir2 phosphorylation through cAMP-PKA and CK2 signaling inhibits the lifespan extension activity of Sir2 in Yeast. eLIFE. (2015) 4:e09709
  • Moon HY, Cheon SA, Kim H, Agaphonov MO, Kwon O, Oh DB, Kim J-Y*, Kang HA*. (* co-corresponding author) Funtional and transcriptome analyses of Hansenula polymorpha Hac1p, a key UPR transcription factor, reveal a critical function in modulating protein N-glycosylation activity. Appl Environ Micriobiol. (2015) 81(20):6982-6993
  • Lee HJ, Kim JM, Kang WK, Yang H, Kim J-Y. The NDR kinase Cbk1 downregulates the transcriptional repressor Nrg1 through the mRNA-binding protein Ssd1 in Candida albicans. Euk Cell. (2015) 14(7):671-83.
  • Bal J, Lee H-J, Cheon SA, Lee KJ, Oh D-B, Kim J-Y. Ylpex5 mutation partially suppresses the defective hyphal growth of a Yarrowia lipolytica ceramide synthase mutant, Yllac1, by recovering lipid raft polarization and vacuole morphogenesis. Fungal Genetics and Biology (2013) 50:1-10
  • Cheon SA, Bal J, Song Y, Hwang HM, Kim AR, Kang WK, Kang HA, Hannibal-Bach HK, Knudsen J, Ejsing CS, Kim J-Y. Distinct roles of two ceramide synthases, CaLag1p and CaLac1p, in the morphogenesis of Candida albicans. Mol Microbiol. (2012) 83(4):728-745
  • Kim J-Y, Oh MH, Bernard LP, Macara I, Zhang H. The RhoG/ELMO1/Dock180 signaling module is required for spine morphogenesis in hippocampal neurons. J. Biol. Chem. (2011) In press.
  • Park J-N, Song Y, Cheon SA, Kwon O, Oh D-B, Jigami Y, Kim J-Y*, Kang HA* (*Co-corresponding) Essential role of YlMPO1, a novel Yarrowia lipolytica homologue of Saccharomyces cerevisiae MNN4, in mannosylphosphorylation of N-and O-linked glycans. Appl. Environ. Microbiol. (2011) 77:1187-1195
  • Oh MH, Cheon SA, Kang HA, Kim JY. Functional characterization of the unconventional splicing of Yarrowia lipolytica HAC1 mRNA induced by unfolded protein response. Yeast. (2010) 27: 443-452
  • Eun Young Cho, Seon Ah Cheon, Hyunah Kim, Jinho Choo, Dong-Jik Lee, Ho Myung Ryu, Sang Ki Rhee, Bong-Hyun Chung, Jeong-Yoon Kim, Hyun Ah Kang. Multiple-yapsin-deficient mutant strains for high-level production of intact recombinant proteins in Saccharomyces cerevisiae J Biotechnol (2010) 149: 1-7
  • Seon Ah Cheon. Jinho Choo, Vera M. Ubiyvovk, Jeong-Nam Park, Moo Woong Kim, Doo-Byoung Oh, Ohsuk Kwon, Andriy A. Sibirny, Jeong-Yoon Kim and Hyun Ah Kang. New selectable host–-marker systems for multiple genetic manipulations based on TRP1, MET2 and ADE2 in the methylotrophic yeast Hansenula polymorpha Yeast (2009) Yeast 26: 507–521.
  • Yunkyoung Song, Seon Ah Cheon, Kyung Eun Lee, So-Yeon Lee, Byung-Kyu Lee, Doo-Byung Oh, Hyun Ah Kang, and Jeong-Yoon Kim. Role of the RAM Network in Cell Polarity and Hyphal Morphogenesis in Candida albicans. Molecular Biology of the Cell (2008) 19: 5456–5477
  • Yoon SW, Lee CH, Kim JY, Kim JY, Sung MH, Poo H. Lactobacillus casei secreting alpha-MSH induces the therapeutic effect on DSS-induced acute colitis in Balb/c Mice. J Microbiol Biotechnol. (2008) 18(12):1975-83.
  • Park SW, Chung MG, Lee HY, Kim JY, Rhee YH. Stable expression and secretion of polyhydroxybutyrate depolymerase of Paucimonas lemoignei in Escherichia coli. J Microbiol. (2008) 46(6):662-9.
  • Kwon JS, Bal J, Hwang HM, Kim JY. A circularly permuted beta-lactamase as a novel reporter for evaluation of protein cyclization efficiency. J Microbiol. (2008) 46(4):456-61.
  • Yoon SW, Chun JS, Sung MH, Kim JY, Poo H. alpha-MSH inhibits TNF-alpha-induced matrix metalloproteinase-13 expression by modulating p38 kinase and nuclear factor kappaB signaling in human chondrosarcoma HTB-94 cells. Osteoarthritis Cartilage. (2008) 16(1):115-24.
  • Song Y, Choi MH, Park J-N, Kim MW, Kim EJ, Kang HA, and Kim J-Y. Engineering of the yeast Yarrowia lipolytica for the production of glycoproteins lacking the outer chain mannose residues of N-glycans. Appl. Environ. Microbiol. (2007) 73(4): 4446-4454
  • Kang WK, Park E-K, Lee HS, Park B-Y, Chang J-Y, Kim M-Y, Kang HA, and Kim, J-Y. A biologically active angiogenesis inhibitor, human serum albumin-TIMP-2 fusion protein, secreted from Saccharomyces cerevisiae. Prot. Exp. Purif. (2007) 53: 331-338
  • Hwang JS, Seo DH and Kim J-Y. Soluble forms of YlCrh1p and YlCrh2p, cell wall proteins of Yarrowia lipolytica, have beta-1,3-glycosidase activity. Yeast (2006) 23:803-812.
  • Song Y and Kim J-Y. Role of CaBud6p in the Polarized Growth of Candida albicans. J. Microbiol. (2006) 44(3):311-319
  • Kim MW, Kim EJ, Kim J-Y, Park J-S, Oh DB, Shimma Y, Chiba I, Jigami Y, Rhee SK and Kang HA. Functional Characterization of the Hansenular polymorpha HOC1, OCH1, and OCR1 genes as members of the yeast OCH1mannosyltransferase family involved in protein glycosylation. J. Biol. Chem. (2006) 281(10): 6261-6272.
  • Kang HA, Kang WK, Go, SM, Rezaee A, Krishna SH, Rhee SK, Kim J-Y. Characteristics of Saccharomyces cerevisiae gal1Delta and gal1Deltahxk2Delta mutants expressing recombinant proteins from the GAL promoter. Biotechnol Bioeng. (2005) 89(6):619-629.
  • Kim MW, Rhee SK, Kim JY, Shimma Y, Chiba Y, Jigami Y, Kang HA. Characterization of N-linked oligosaccharides assembled on secretory recombinant glucose oxidase and cell wall mannoproteins from the methylotrophic yeast Hansenula polymorpha. Glycobiology. (2004) 14(3):243-251.
  • Heo J-H, Hong WK, Cho EY, Kim MW, Kim J-Y, Kim CH, Rhee S.K, and Kang HA. Properties of the Hansenula polymorpha-derived constitutive GAP promoter, assessed using an HSA reporter gene. FEMS Yeast Research (2003) 4:175-184.
  • Song Y, Cheon SA, Lee S-Y, Hwang J-S, and Kim J-Y. Isolation and Characterization of Bud6p, an actin interacting protein, form Yarrowia lipolytica. J. Microbiol. (2003) 41(2):121-128
  • Choi GG, Kim MW, Kim J-Y, and Rhee YH Production of poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate) with high molar fractions of 3-hydroxyvalerate by a threonine-overproducing mutant of Alcaligenes sp. SH-69. Biotechnol. Lett. (2003) 25:665-670
  • Ryu HM, Kang WK, Kang HA, and Kim J-Y. Secretion of active urokinase-type plasminogen activator from the yeast Yarrowia lipolytica. Biotechnol. Bioprocess Eng. (2003) 8:162-165
  • Cheon SA, Han EJ, Kang HA, Ogrydziak DM, and Kim J-Y. Isolation and characterization of the TRP1 gene from the yeast Yarrowia lipolytica and multiple gene disruption using a TRP blaster. Yeast (2003) 20(8): 677-685
  • Kim J, Cheon SA, Song Y, and Kim J-Y. Cloning and characterization of the multiprotein bridging factor 1 (YlMBF1) gene from the dimorphic yeast Yarrowia lipolytica. J. Microbiol. (2002) 40(2):173-177
  • Kim MW, Agaphonov MO, Kim J-Y, Rhee SK, and Kang HA. Sequencing and functional analysis of the Hansenula polymorpha genomic fragment containing the YPT1 and PMI40 genes. Yeast (2002) 19:863-871
  • Kang HA, Kang W, Hong WK, Kim MW, Kim J-Y, Sohn J-H, Choi E-S, Choe K-B, and Rhee SK. Development of expression systems for the production of recombinant human serum albumin using the MOX promoter in Hansenula polymorpha DL-l. Biotechnol. Bioeng. (2001) 76(2):175-185
  • Kim EA, Lee JG, Whang MK, Park HM, Kim JY, Chae SK, and Maeng PJ. Controlled expression and secretion of Aspergillus oryzae alkaline protease in Aspergillus nidulans. J. Microbiol. (2001) 39(2): 95-101.
  • Yang J, Kang HA, Ko S-M, Chae S-K, Ryu, DDY, and Kim J-Y. Cloning of the Aspergillus niger pmrA gene, a homologue of yeast PMR1, and characterization of a pmrA null mutant. FEMS Microbiol. Lett. (2001) 199(1):97-102
  • Lee HH, Chae SK, Kim J-Y, Maeng P.J, and Park HM. Genomic organization of the ancop gene for α-COP homolog from Aspergillus nidulans. Mycobiology. (2000) 28(4):171-176
  • Kim J, Cheon SA, Park S, Song Y, and Kim J-Y. Serum-induced hypha formation in the dimorphic yeast Yarrowia lipolytica. FEMS Microbiol. Lett. (2000) 190: 9-12
  • Kim MW, Ko S-M, Kim J-Y, Sohn J-H, Choi E-S, Kang HA, and Rhee S-K. Effect of a PMR1 disruption on the procesing of heterologous glycoproteins secreted in the yeast Saccharomyces cerevisiae. Biotechnol. Bioprocess Eng. (2000) 5(4):234-241
  • Kim J-W, Park TJ, Ryu DDY, and Kim J-Y. High cell density cultivation of Yarrowia lipolytica using a one-step feeding process. Biotechnol. Prog. (2000) 16:657-660
  • Kang HA, Choi E-S, Hong W-K, Kim J-Y, Ko S-M, Shon J-H, Rhee S-K. Proteolytic stability of recombinant human serum albumin secreted in the yeast Saccharomyces cerevisiae Appl. Microbiol. Biotechnol (2000) 53(5):575-582

관심분야

세포극성 형성 및 제어 연구(Cell Signaling for Cell Polarity)
  • Unbalanced Balance or Balanced Imbalance ?

    세균에서 부터 동물세포에 이르기 까지 모든 세포는 형태 및 기능적인 면에서 비대칭적(Asymmetry)인 특성을 가지고 있는데 이를 세포극성(Cell Polarity)이라고 한다.
    세포는 각자의 기능에 가장 알맞은 형태(비대칭적인 형태)와 세포 내 기능적 극성을 유지하기 위해 단백질, mRNA 등의 생체구성 물질의 형성과 이동을 시간적, 공간적으로 정교하게 조절해야만 한다.
    만일 세포가 이런 조절능력을 잃어버리면 세포는 원래의 기능을 상실하고 암세포나 노화된 세포와 같이 비정상적인 세포로 변하게 된다.
    본 연구실에서는 신경세포 (Hippocampal Neuronal Cells) 및 병원성 효모 (Candida albicans)에서 세포극성이 만들어지고 유지되는 기전을 분자수준에서 연구한다.

  • 1. 신경세포 (Hippocampal Neuronal Cells)

    쥐 뇌신경세포(Hippocampal neurons)의 극성 형성 및 기능 유지에 중요한 새로운 단백질들을 규명하고 분자세포생물학적 기능을 밝히는 연구를 수행하고 있다.

    • Dendrite 형성에 매우 중요한 역할을 하는 NDR kinase의 기능을 분석하고, 이와 관련된 신호전달경로를 밝히는 연구를 수행하고 있다.
    • Dendritic spine 형성에 필요한 새로운 Rho GEF (Guanine Nucleotide Exchange Factor)를 발굴하고 기능을 밝히는 연구를 수행하고 있다.
  • 2. 기회감염성 병원성 진균 (Candida albicans)

    병원성 진균인 Candida albicans의 병원성에 중요한 역할을 하는 균사형성(hypha formation)에 필요한 단백질들에 관한 연구를 수행하고 있다.

    • C. albicans 극성생장 및 균사형성에 필수적인 NDR kinase(RAM pathway)의 세포 내 기능과 동물세포 침투 시 역할에 대한 연구를 수행하고 있다.
    • Ceramide synthase가 세포극성을 형성하고 유지하는데 어떠한 역할을 하는 지에 대한 연구를 수행하고 있다.

세포및분자생물공학실험실

Cellular & Molecular Biotechnology

세포 극성(Cell Polarity)은 모든 세포에서 나타나는 근본적인 현상으로서, 세포의 형태 또는 세포 구성성분 및 기능에 있어서 나타나는 비대칭성(Asymmetry)을 지칭한다. 이는 세포내 물질 수송과 분화 및 형태 유지와 같은 기본적인 세포기능에 필수적이기 때문에, 만일 세포가 극성을 잃어버리면 세포는 원래의 기능을 상실하고 암세포나 노화된 세포와 같이 비정상적인 세포가 된다. 세포가 필요에 따라 알맞은 형태적(비대칭적인 형태), 기능적 극성을 유지하기 위해서는 특정 단백질, mRNA 등의 생체구성 물질의 형성과 이동이 시간적, 공간적으로 정교하게 조절되어야 하며, 이들을 조절하는 신호전달경로는 매우 다양하고 복잡하다.

본 연구실에서는 지난 10여 년간 세포 극성이 만들어지고 유지되는데 필수적인 새로운 단백질들을 규명하고 분자세포생물학적 기능을 밝히는 연구를 수행해 왔으며, 그 중에서도 특히 신경세포(Hippocampal Neuronal Cells)의 분화(Dendrite or Dendritic Spine)와 기회감염성 효모(Candida albicans)의 병원성에서 세포 극성이 조절되는 새로운 기전을 분자수준에서 연구하고 있다.

연구실 구성원

김영혁

김영혁

박사과정-
김종명

김종명

박사과정-
김지예

김지예

박사과정-
마이어

마이어

박사과정-
박태준

박태준

박사과정-
신민기

신민기

박사과정-
이재민

이재민

박사과정-
홍은혜

홍은혜

박사과정-
황해민

황해민

박사과정-
공경수

공경수

석사과정-
김영훈

김영훈

석사과정-
김하현

김하현

석사과정-
이형규

이형규

석사과정-
전혜진

전혜진

석사과정-
정주혜

정주혜

석사과정-
황희곤

황희곤

석사과정-
김별희

김별희

학부과정-
김선우

김선우

학부과정-
이정재

이정재

학부과정-
전효은

전효은

학부과정-