교수진

FACULTY

교수

PROFESSOR
신웅기 교수
  • 이학박사
  • 신웅기
  • Woongghi Shin, Ph.D.
  • Protist Systematics
  • 생명시스템과학대학 403호
  • 원생생물다양성실험실(N11-404호)
  • 042-821-7590
  • shinw@cnu.ac.kr

학력

  • 학사(1990) : 충남대학교 생물학과
  • 석사(1992) : 충남대학교 생물학과
  • 박사(2000) : 충남대학교 생물학과 (식물학)

경력

  • 2000.09 ~ 2002.07 Rutgers University, Post-Doc
  • 2002.08 ~ 2004.01 Michigan State University, Post-Doc
  • 2004.02 ~ 충남대학교 생물학과 조교수, 부교수, 교수

연구업적

  • Kim, J. I., Yoon, H. S., Yi, G., Shin, W., Archibald, J. M. 2018. Comparative mitochondrial genomics of cryptophyte algae: gene shuffling and dynamic mobile genetic elements. BMC Genomics (accepted)
  • Jeong, J., Baek, K., Yu, J., Kirst, H., Betterle, N., Shin, W., Bae, S., Melis, A., Jin, E. 2018. Deletion of the chloroplast LTD protein impedes 3 LHCI import and PSI4 LHCI assembly in Chlamydomonas reinhardtii. J. Exp. Bot. (in press)
  • Kim, J. I., Moore, C. E., Archibald, J. M., Bhattacharya, D., Yi, G., Yoon, H. S., Shin, W. 2017. Evolutionary dynamics of cryptophyte plastid genomes. Genome Biol. Evol. 9: 1859-1872.
  • Gusev, E. S., Siver, P. A. Shin, W. 2017. Mallomonas bronchartiana Compere revisited: Two new species described from Asia. Cryptogamie Algol. 38: 3-16.
  • Kim, J. I., Nam, S. W., So, J. E., Hong, S. G., Choi, H.-G., Shin, W. 2017. Asterochloris sejongensis sp. nov. (Trebouxiophyceae, Chlorophyta) from King George Island, Antarctica. Phytotaxa 295: 60-70.
  • Zimba, P. V., Huang, I-S., Gutierrez, D., Shin, W., Bennett, M. S., Triemer, R. E. 2017. Euglenophycin is produced in at least six species of euglenoid algae and six of seven strains of Euglena sanguinea. Harmful Algae 63: 79-84.
  • Nam, S. W., Park, J. W., Yih, W., Park, M. G., Shin, W. 2016. The fate of cryptophyte cell organelles in the ciliate Mesodinium cf. rubrum subjected to starvation. Harmful Algae 59: 19-30.
  • Jo, B. Y., Kim, J. I., Skaloud, P., Siver, P., Shin, W. 2016. Multigene phylogeny of Synura (Synurophyceae) and description of four new species based on morphological and DNA evidence. Eur. J. Phycol. 51:413-430.
  • Kim, J. I., Linton, E. W., Shin, W. 2016. Morphological and genetic diversity of Euglena deses group (Euglenophyceae) with emphasis on cryptic species. Algae 31:219-230.
  • Nam, S. W., Shin, W. 2016. Ultrastructure of the flagellar apparatus in cryptomorphic Cryptomonas curvata (Cryptophyceae) with an emphasis on taxonomic and phylogenetic implications. Algae 31:117-128.
  • Kim, G. H., Han, J. H., Kim, B., Han, J. W., Nam, S. W., Shin, W., Park, J. W., Yih, W. 2016. Cryptophyte gene regulation in the kleptoplastidic, karyokleptic ciliate Mesodinium rubrum. Harmful Algae 52:23-33.
  • Moon, E., Nam, S. W., Shin, W., Park, M. G., Coats, D. W. 2015. Do all dinoflagellates have an extranuclear spindle? Protist 166: 569-584.
  • Kim, J. I., Linton, E. W., Shin, W. 2015. Taxon-rich multigene phylogeny of the photosynthetic euglenoids (Euglenophyceae). Front. Ecol. Evol. 3:98.
  • Siver, P. A., Jo, B. Y., Kim, J. I., Shin, W., Lott, A. M., Wolfe, A. 2015. Assessing the evolutionary history of the class Synurophyceae (heterokonta) using molecular, morphometric, and paleobiological approaches. Am. J. Bot. 102:921-941.
  • Hong, J. W., Jo, S.-W., Cho, H.-W., Nam, S. W., Shin, W., Park, K. M., Lee, K. I., Yoon, H.-S. 2015. Phylogeny, morphology, and physiology of Micractinium strains isolated from shallow ephemeral freshwater in Antarctica. Phycol. Res. 63:212-218.
  • Kim, J. I., Yoon, H. S., Yi, G., Kim, H. S., Yih, W., Shin, W. 2015. The plastid genome of the cryptomonad Teleaulax amphioxeia. PLoS ONE 10(6): e0129284.
  • Kim, M., Nam, S. W., Shin, W., Coats, D. W., Park, M. G. 2015. Fate of green plastids in Dinophysis caudata following ingestion of the benthic ciliate Mesodinium coatsi: Ultrastructure and psbA gene. Harmful Algae 43: 66-73.
  • Nam, S. W., Shin, W., Kang, M., Yih, W., Park, M. G. 2015. Ultrastructure and molecular phylogeny of Mesodinium coatsi sp. nov., a benthic marine ciliate. J. Eukaryot. Microbiol. 62:102-120.
  • Arguelles, E.D.L.R., Martinez-Goss, M. R., Shin, W. 2015. Some noteworthy photosynthetic euglenophytes from Los Banos, Laguna (Philippines) and its vicinities. Philipp. Sci. 51:1-36.
  • Kim, J. I., Shin, W. 2014. Molecular phylogeny of the genus Phacus (Phacaceae, Euglenophyceae) and the descriptions of seven new species. J. Phycol. 50: 948-959.
  • Kim, M., Kim, G. Y., Nam, S. W., Shin, W., Yih, W., Park, M. G. 2014. The effect of starvation on plastid number and photosynthetic performance in the kleptoplastidic dinoflagellate Amylax triacantha. J. Eukaryot. Microbiol. 61:354-363.
  • Kim, H. S., Kim, J. H., Shin, W., Jo, B. Y. 2014. Mallomonas elevata sp. nov. (Synurophyceae), a new scaled chrysophyte from Jeju Island, South Korea. Nov. Hedw. 98: 89-102.
  • Kottuparambil, S., Kim, Y.-J., Choi, H., Kim, M.-S., Park, A., Park, J., Shin, W., Han, T. 2014. A rapid phenol toxicity test based on photosynthesis and movement of the freshwater flagellate, Euglena agilis Carter. Aquatic Toxicol. 155: 9-14.
  • Nam, S. W., Go, D., Son, M, Shin, W. 2013. Ultrastructure of the flagellar apparatus in Rhinomonas reticulata var. atrorosea (Cryptophyceae, Cryptophyta). Algae 28:331-341.
  • Choi, B., Son, M., Kim, J. I., Shin, W. 2013. Taxonomy and phylogeny of the genus Cryptomonas (Cryptophyceae, Cryptophyta) from Korea. Algae 28: 307-330.
  • Jo, B. Y., Shin, W., Kim, H. S., Siver, P. A., Andersen, R. A. 2013. Phylogeny of the genus Mallomonas (Synurophyceae) and descriptions of five new species based on morphological evidence. Phycologia 52:266-278.
  • Kim, J. I., Shin, W., Triemer, R. E. 2013. Cryptic speciation in the genus Cryptoglena (Euglenaceae) revealed by nuclear and plastid SSUand LSU rRNA gene. J. Phycol. 49:92-102.
  • Kim, J. I., Shin, W., Triemer, R. E. 2013. Phylogenetic reappraisal of the genus Monomorphina (Euglenophyceae) based on molecular and morphological data. J. Phycol. 49:82-91.
  • Siver, P. A., Wolfe, A. P., Rohlf, F. J., Shin, W., Jo, B. Y. 2013. Combining geometric morphometrics, molecular phylogeny and micropaleontology to assess evolutionary patterns in Mallomonas (Synurophyceae: Heterokontophyta). Geobiology. 11:127-138.

관심분야

  • 원생생물의 계통분류학

    • 해양 및 담수에 서식하는 원생생물의 채집, 배양
    • 다양한 분자마커를 이용한 원생생물의 다양성 탐색
    • 형태 및 분자 자료를 이용한 원생생물의 계통 및 분류학적 연구
  • 미세구조 연구

    • 주사전자현미경 (SEM)과 투과전자현미경 (TEM)을 이용한 미세구조 관찰
    • 미세구조 분석을 통한 형태적 다양성 이해
  • 원생생물의 유전체 연구

    • 핵 유전체 분석을 통한 원생생물의 계통 및 진화 과정을 이해
    • 세포소기관의 기원과 진화 과정을 규명

원생생물다양성실험실

Protist Diversity

본 원생생물 다양성 연구실은 2004년 충남대학교 생명과학부에 설립된 이후, 광합성 원생생물 (미세조류, microalgae)의 분류 및 진화에 관한 연구를 수행하고 있다. 연구실에서는 다양한 광합성 원생생물을 연구 대상으로 한다. 원생생물을 대상으로 하는 학문 분야 중에서 가장 기초 학문 분야이며, 순수학문 분야이다. 본 연구실은 광합성 원생생물의 분류 및 계통연구를 수행하기 위하여 다양한 방법을 적용하여 연구를 수행하고 있다.

광합성 원생생물 분류에 이용하고 있는 방법은 분자 계통학적 방법, 형태학적 방법, 그리고 유전체의 정보 (핵, 색소체, 미토콘드리아)를 이용하는 방법이 있다. 분자계통학적 방법은 다양한 분자 마커 (nuclear SSU & LSU rDNA, plastid SSU & LSU rDNA, 그리고 psbA 등)를 이용하여 종간 또는 속간의 계통적 유연관계를 밝히는데 그 목적을 두고 있다. 형태학적 연구는 광학현미경 (LM)과 전자현미경 (SEM & TEM)을 이용하고 있다. 특히, 전자현미경은 분류 및 진화적으로 중요한 미세구조를 밝히는데 이용되고 있다. 아울러 핵이나 세포소기관의 유전체를 분석하여 주요 종 또는 분류군의 진화와 유전자의 획득 및 이동과정을 이해한다.

연구실 구성원

김종임

김종임

연구원-
Neha Ingole Pravin

Neha Ingole Pravin

박사과정-
Jasmine Ruth Anto

Jasmine Ruth Anto

박사과정-
정민석

정민석

석박사통합과정-
김용준

김용준

석사과정-
왕예동(王藝童)

왕예동(王藝童)

석사과정-
신현문

신현문

석사과정-