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미생물·분자생명과학과

FACULTY
김정윤
  • 이학박사
  • 김정윤
  • Jeong-Yoon Kim, Ph.D.
  • 세포노화, 세포극성
  • 생명시스템과학대학 605호
  • 세포노화 연구실 (N11-605호)
  • 042-821-6419
  • jykim@cnu.ac.kr
  • 학사(1984) : 서울대학교 미생물학과 (이학사)
  • 석사(1986) : 서울대학교 미생물학과 (이학석사)
  • 박사(1992) : University of California, Davis (이학박사)
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관심분야

세포노화 (Cellular Aging)

  • 세포는 분열을 하면 그리고/또는 시간이 지나면 노화가 된다. 이런 세포노화에 영향을 미치는 중요한 요인들로는 genome stability, telomere attrition, loss of proteostasis, epigenetic alteration, deregulated nutrient sensing, mitochondrial dysfunction 등이 있다. 본 연구실에서는 nutrient (또는 Calorie Restriction)에 의한 영양분신호전달경로 및 생리대사 변화가 세포노화와 어떻게 연결이 되는 지를 분자수준에서 연구한다.

    • 영양분에 의해 활성이 조절되는 Sirtuin 단백질(class III histone deacetylase)과 TOR 단백질이 관여하는 신호전달경로가 세포노화에 미치는 영향을 분자수준에서 연구한다.
    • 미토콘드리아 dynamics와 기능이 세포노화에 미치는 영향을 분자수준에서 연구한다. 특히, Sirtuin 단백질 기능과 연관된 메커니즘에 관한 연구를 수행한다.

세포극성 (Cell Polarity)

  • 진핵세포는 각자의 기능에 가장 알맞은 형태(비대칭적인 형태)와 세포 내 기능적 극성을 유지하기 위해 단백질, mRNA 등의 생체구성 물질의 형성과 이동을 시간적, 공간적으로 정교하게 조절해야만 한다. 만일 세포가 이런 조절능력을 잃어버리면 세포는 원래의 기능을 상실하게 되고, 때에 따라서 암세포 또는 노화된 세포와 같이 비정상적인 세포로 변해서 질병이 유발된다. 본 연구실에서는 중점적으로 수행하는 연구는 다음과 같다.

    • TOR 신호전달경로 또는 미토콘드리아 기능과 신경세포 dendrite, spine 형성과의 관계를 분자수준에서 연구한다.
    • Small GTPase 활성을 조절하는 인자(GEF, GAP 등)가 신경세포 dendrite, spine 형성 그리고 neuronal cell migration에 미치는 영향을 분자수준에서 연구한다.

경력

  • 1987-1988 : 유전공학연구소 연구원
  • 1992-1993 : UC Davis, 화학공학과 박사후 연구원
  • 1993-현재 : 충남대학교 미생물·분자생명과학과 교수
  • 2008-2009 : Univ. of Virginia, 의과대학 세포신호전달센터 방문교수
  • 2017-2018 : 충남대학교 생명시스템과학대학 학장

연구업적 (2010~)

  • Hong E-H, Kim J, Kim J-H, Lim D-S, Kim M, Kim J-Y. BIG2-ARF1-RhoA-mDia1 signaling regulates dendritic Golgi polarization in hippocampal neurons. Mol Neurobiol. (2018) 55(10):7701-7716
  • Hwang H-M, Heo C-K, Lee HJ, Kwak S-S, Lim W-H, Yoo J-S, Yu D-Y, Lim KJ, Kim J-Y*, Cho E-W*. (* co-corresponding author) Identification of anti-SF3B1 autoantibody as a diagnostic marker in patients with hepatocellular carcinoma. J Transl Med. 2018. 16:177
  • Kim H, Thak EJ, Yeon JY, Sohn MJ, Choo JH, Kim J-Y*, and Kang HA*. (* co-corresponding author) Functional analysis of Mpk1-mediated cell wall integrity signaling pathway in the thermotolerant methylotrophic yeast Hansenula polymorpha. J Microbiol. (2018) 56(1):72-82
  • Thak EJ, Kim J, Lee D-J, Kim J-Y, and Kang HA. Structural analysis of N-/O-glycans assembled on proteins in yeasts. J. Microbiol. (2018) 56(1):11-23
  • Kang WK, Devare M, Kim J-Y. HST1 increases replicative lifespan of a sir2 mutant in the absence of PDE2 in Saccharomyces cerevisiae. J Microbiol. (2017) 55(2):123-129
  • Kim YH, Kang J-Y, Gil JY, Kim S-Y, Shin KK, Kang HA, Kim J-Y, Kwon O, and Oh D-B. Abolishment of N-glycan mannosylphosphorylation in glyco-engineered Saccharomyces cerevisiae by double disruption of MNN4 and MNN14 genes. Appl Microbiol Biotechnol. (2017) 101:2979-2989
  • Kim J-Y. Human fungal pathogen: Why should we learn? J Microbiol. (2016) 54(3):145-148
  • Kang WK, Kim YH, Kang HA, Kwon K-S, Kim J-Y. Sir2 phosphorylation through cAMP-PKA and CK2 signaling inhibits the lifespan extension activity of Sir2 in Yeast. eLIFE. (2015) 4:e09709
  • Moon HY, Cheon SA, Kim H, Agaphonov MO, Kwon O, Oh DB, Kim J-Y*, Kang HA*. (* co-corresponding author) Funtional and transcriptome analyses of Hansenula polymorpha Hac1p, a key UPR transcription factor, reveal a critical function in modulating protein N-glycosylation activity. Appl Environ Micriobiol. (2015) 81(20):6982-6993
  • Lee HJ, Kim JM, Kang WK, Yang H, Kim J-Y. The NDR kinase Cbk1 downregulates the transcriptional repressor Nrg1 through the mRNA-binding protein Ssd1 in Candida albicans. Euk Cell. (2015) 14(7):671-83.
  • Kang WK, Kim YH, Kim B-S, Kim J-Y. Growth Phase-dependent Roles of Sir2 in Oxidative Stress Resistance and Chronological Lifespan in Yeast. J Microbiol. (2014) 52(8):652-58
  • Bal J, Lee H-J, Cheon SA, Lee KJ, Oh D-B, Kim J-Y. Ylpex5 mutation partially suppresses the defective hyphal growth of a Yarrowia lipolytica ceramide synthase mutant, Yllac1, by recovering lipid raft polarization and vacuole morphogenesis. Fungal Genetics and Biology (2013) 50:1-10
  • Kang WK, Lee MH, Kim YH, Kim MY, Kim J-Y. Enhanced secretion of biologically active, non-glycosylated VEGF from Saccharomyces cerevisiae J. Biotechnol. (2013) 164(4):441-8
  • Moon HY, Van TL, Cheon SA, Choo J, Kim J-Y, Kang HA. Cell-surface expression of Aspergillus saitoi-derived functional α-1,2-mannosidase on Yarrowia lipolytica for glycan remodeling. J Microbiol. (2013) 51(4):506-14.
  • Kim OC, Suwannarangsee S, Oh D-B, Kim S, Seo J-W, Kim CH, Kang HA, Kim J-Y, Kwon O. Transcriptome analysis of xylose metabolism in the thermotolerant methylotrophic yeast Hansenula polymorpha. Bioprocess Biosyst Eng. (2013) 36(10):1509-10518
  • Cheon SA, Bal J, Song Y, Hwang HM, Kim AR, Kang WK, Kang HA, Hannibal-Bach HK, Knudsen J, Ejsing CS, Kim J-Y. Distinct roles of two ceramide synthases, CaLag1p and CaLac1p, in the morphogenesis of Candida albicans. Mol Microbiol. (2012) 83(4):728-745
  • Sohn MJ, Oh D-B, Kim EJ, Cheon SA, Kwon O, Kim J-Y, Lee SY, Kang HA. HpYPS1 and HpYPS7 encode functional aspartyl proteases localized at the cell surface in the thermotolerant methylotrophic yeast Hansenula polymorpha. Yeast (2012) 29(1):1-16
  • Kim P, Lee J-C, Pa가 D-J, Shin K-S, Kim J-Y, Kim C-J. Gracilibacillus bigeumensis sp. nov., a moderately halophilic bacterium from solar saltern soil. IJSEM (2012) 62:1857–1863
  • Lee SM, Dho SH, Ju SK, Maeng JS, Kim J-Y, Kwon KS. Cytosolic malate dehydrogenase regulates senescence in human fibroblasts. Biogerontology. (2012) 13(5):525-36
  • Kim J-Y, Oh MH, Bernard LP, Macara I, Zhang H. The RhoG/ELMO1/Dock180 signaling module is required for spine morphogenesis in hippocampal neurons. J. Biol. Chem. (2011) 286(43):37615-24
  • Park J-N, Song Y, Cheon SA, Kwon O, Oh D-B, Jigami Y, Kim J-Y*, Kang HA* (*Co-corresponding) Essential role of YlMPO1, a novel Yarrowia lipolytica homologue of Saccharomyces cerevisiae MNN4, in mannosylphosphorylation of N-and O-linked glycans. Appl. Environ. Microbiol. (2011) 77:1187-1195
  • Oh MH, Cheon SA, Kang HA, Kim J-Y. Functional characterization of the unconventional splicing of Yarrowia lipolytica HAC1 mRNA induced by unfolded protein response. Yeast. (2010) 27:443-452
  • Cho EY, Cheon SA, Kim H, Choo J, Lee D-J, Ryu HM, Rhee SK, Chung B-H, Kim J-Y, Kang HA. Multiple-yapsin-deficient mutant strains for high-level production of intact recombinant proteins in Saccharomyces cerevisiae. J Biotechnol (2010) 149:1-7

저서 및 특허

국내특허

  • 김정윤, 정헌세, 채순기, 박희문, 맹필재 (1999. 4.) 단백질 분해 효소 결함 아스퍼질러스 나이거 변이주. 등록번호 특허 제 0205622 호
  • 김정윤, 이일, 이영하 (1999. 12) PHA 생합성 유전자를 포함하는 플라즈미드 및 이 플라즈미드에 의해 형질전환된 대장균. 특허 제 0247947 호
  • 김정윤, 김민영, 박은규, 장재영, 강현아 (2004.07.13) 인간 혈청 알부민-팀프-2 융합 단백질 발현시스템 및 재조합 인간 혈청 알부민-팀프-2 융합 단백질. 특허 제 0441384 호
  • 김정윤, 강현아, 한은정, 강우규 (2006. 01. 17) 재조합 단백질 생산 능력이 향상된 사카로마이세스세레비지애 변이주 특허 제 10-0545563 호
  • 김정윤, 이경민 (2007. 3. 22) 야로이아 속 효모에서의 세포 표면 단백질을 이용한 목적단백질의 세포 표면 발현방법. 특허 제 10-0701209 호
  • 박정남, 송윤경, 김정윤, 오두병, 강현아 (2009. 08. 28) 야로이아 리폴리티카 유래의 신규 YlMPO1 유전자 및 이의 파쇄 균주를 이용한 만노스 인산이 제거된 당단백질 생산방법. 특허 제 10-0915670 호
  • 김정윤, 강우규, 이민형 (2015. 09. 03) 효모를 이용한 인간 비당화 혈관내피세포성장인자 생산방법. 특허 제 10-1552016 호

국제특허

  • Kim, Jeong-Yoon, Min-Young Kim, Eun-Kyu Park, Jae-Young Chang, and Hyun-Ah Kang (2007. 1. 17) Human serum albumin-TIMP2 fusion protein, a polynucleotide encoding the same and a method of producing the human serum albumin-TIMP2 fusion protein. U.S. 7,163,805 B2 (application no. 10/888,887)
  • Kang, Hyun Ah, Sang Ki Rhee, Min Jung Sohn, Jeong-Yoon. Kim. (2007. 8. 28) Hansenula polymorpha Yapsin deficient mutant strain and process for the preparation of recombinant proteins using the same. U.S. 7,262,287 (U.S. Application No. 10/518,377; 2004.12.28.)